日前,浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院園藝系張明方教授團(tuán)隊(duì)通過高通量測序技術(shù),繪制了世界上第一張榨菜全基因圖譜,將對芥菜類蔬菜作物的改良產(chǎn)生重要意義。
芥菜屬于蕓薹屬的一類重要蔬菜,包括榨菜、大頭菜、雪里蕻等。芥菜由蕓薹屬的兩個(gè)二倍體基本種白菜(A基因組)和黑芥(B基因組)通過雜交和基因組加倍形成,屬于異源四倍體基因組(AABB)。通過測序分析,確定了芥菜的A基因組來源,揭示了芥菜多倍體基因組上同源基因的表達(dá)與選擇機(jī)制。發(fā)現(xiàn)顯著差異表達(dá)的同源基因具有更快的進(jìn)化速率,且芥菜中菜用和油用類群的分化與同源基因差異表達(dá)相關(guān),表明同源基因差異表達(dá)對多倍體演化起著重要作用。研究發(fā)現(xiàn),芥菜物種形成于3.9萬-5.5萬年前,為單一地理起源,其A亞基因組與白菜型油菜親緣關(guān)系更近,然后演化成蔬菜用和油用芥菜兩個(gè)主要類群。 芥菜和黑芥基因組的測序分析,將為芥菜類作物的優(yōu)異基因資源挖掘和農(nóng)藝性狀改良打下基礎(chǔ)。
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