光路不平衡干擾：

一臺紅外線氣體分析儀預熱后通入氮氣時，輸出很大，這是由于切光片相位不平衡及光路不平衡引起，因此只要調整相位調節選鈕使輸出達到小，再調整光路平衡選鈕使輸出最小即可。然后同零點氣和量程氣，反復校準儀表零點和量程。

水分干擾：

零點氣中若有水分，紅外線氣體分析器標定后，會引起負誤差，在近紅外區域，水有連續的特征吸收波譜，若標定用的零點氣中含有水分時，將造成儀器的零位的負偏，標定后儀器示值必然比實際值偏低，從而起負誤差。

溫度變化的干擾：

紅外線氣體分析儀檢測過程需要在恒定的溫度下進行。環境溫度發生變化將直接影響紅外光源的穩定，影響紅外輻射的強度，影響測量氣室連續流動的氣樣密度，還將直接影響檢測器的正常工作。如果溫度大大超過正常狀態，檢測器的輸出阻抗下降，導致儀器不能正常工作，甚至損壞檢測器。紅外分析儀內部一般有溫控裝置及超溫保護電路，即使如此，有的儀器示值特別是微量分析儀器，亦可觀察出環境溫度變化對檢測的影響，在夏季環境溫度較高時尤為明顯。在這種情況下，需改變環境溫度，設置空調是一種解決辦法。

大氣壓力波動的干擾：

大氣壓力即使在同一個地區、同一天內也是有變化的。若天氣驟變時，變化的幅度較大。大氣壓力的這種變化，對氣樣放空流速有直接影響。經測量氣室后直接放空的氣樣，會隨大氣壓力的變化使氣室中氣樣的密度發生變化，從而造成附加誤差。